Kõik Võru Instituudi tähtsamad tegemised on seotud eesmärgiga toetada piirkondliku keele ja kultuuri säilimist ning arengut kaasaegses ühiskonnas. Turumajandus soosib suuri keeli, võru keele sugused väikese kõnelejaskonnaga keeled ei suuda enamuskeeltega võrdsetel alustel konkureerida. Teiste väikeste keelte kogemus on näidanud, et üleilmastumise käigus ei jää kirjakeeleta keel püsima. Seega ei saa keelise mitmekesisuse ja väikeste keelte hoidmine piirduda üksnes kõnekeele toetamisega, vaja on ka omakeelset trükisõna ja meediat, kultuurielu ja haridust. Ühe seni vaid suulises kasutuses olnud keele kujunemisel tänapäevaseks keeleks tekib probleeme ja küsimusi. Näiteks, kuidas panna keelt kirja, kas ja millist paljudest murretest eelistada õpiku- ja tarbetekstides, kes on pädev keeleasju otsustama, kuidas laiendada keele kasutussfääre. Paraku pole keelt võimalik kaitsta ega toetada, kui pole piisavalt uuritud keele ajalugu ja keelekasutuse hetkeseisu. Sellest tulenevalt on instituudi töö põhisuunad:

• keeleteaduslikud uuringud
• sotsioloogilised uuringud
• kooliõpetus
• igapäevase keelekasutuse toetamine ja elavdamine